Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIFKQ9BYG3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms