Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAPERQ9BY12 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAPERQ9BY12 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms