Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms