Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORT1Q99523 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms