Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms