Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX18Q96RF0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms