Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms