Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85AQ96PX6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms