Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms