Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NMD3Q96D46 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms