Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYTL4Q96C24 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms