Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms