Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms