Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf47Q8NEP4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms