Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms