Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPC24Q8NBT2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms