Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms