Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1N4

KRT78, Keratin, type II cytoskeletal 78, humanhuman

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT78Q8N1N4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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KRT78Q8N1N4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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KRT78Q8N1N4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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KRT78Q8N1N4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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KRT78Q8N1N4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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KRT78Q8N1N4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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KRT78Q8N1N4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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