Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms