Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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USP53Q70EK8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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USP53Q70EK8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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USP53Q70EK8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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USP53Q70EK8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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