Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBLN3Q6UW01 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBLN3Q6UW01 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBLN3Q6UW01 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBLN3Q6UW01 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBLN3Q6UW01 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBLN3Q6UW01 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBLN3Q6UW01 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBLN3Q6UW01 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBLN3Q6UW01 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBLN3Q6UW01 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms