Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms