Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZB9

DMRTA1, Doublesex- and mab-3-related transcription factor A1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRTA1Q5VZB9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 AP000688.3-201ENST00000445464 348 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 LIF-AS1-201ENST00000447565 808 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 SCARNA7-201ENST00000458797 330 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 CCDC58P5-201ENST00000536923 432 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DMRTA1Q5VZB9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 AL035658.1-201ENST00000415054 357 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 IP6K2-208ENST00000417896 1124 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 AC025171.2-201ENST00000451894 1218 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 AC025572.1-201ENST00000472243 553 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 AC093334.1-201ENST00000559904 423 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMRTA1Q5VZB9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms