Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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SAMD13Q5VXD3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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SAMD13Q5VXD3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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