Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM208BQ5VWN6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms