Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms