Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01545Q5VT33 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms