Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms