Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms