Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MSMPQ1L6U9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms