Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms