Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
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