Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FXNQ16595 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FXNQ16595 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FXNQ16595 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FXNQ16595 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FXNQ16595 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FXNQ16595 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FXNQ16595 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FXNQ16595 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FXNQ16595 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FXNQ16595 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FXNQ16595 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FXNQ16595 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FXNQ16595 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms