Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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