Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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