Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRKQ15262 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
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