Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARHGEF6Q15052 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGEF6Q15052 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms