Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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CHD4Q14839 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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CHD4Q14839 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
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CHD4Q14839 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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CHD4Q14839 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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CHD4Q14839 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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CHD4Q14839 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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CHD4Q14839 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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CHD4Q14839 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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