Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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