Protein–RNA interactions for Protein: Q14203

DCTN1, Dynactin subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN1Q14203 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCTN1Q14203 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms