Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM53BQ14153 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms