Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC3Q14003 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms