Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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TCIRG1Q13488 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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