Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms