Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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ITGB3BPQ13352 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGB3BPQ13352 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
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ITGB3BPQ13352 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
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ITGB3BPQ13352 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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ITGB3BPQ13352 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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ITGB3BPQ13352 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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ITGB3BPQ13352 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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ITGB3BPQ13352 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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ITGB3BPQ13352 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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ITGB3BPQ13352 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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