Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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