Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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MRPL28Q13084 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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MRPL28Q13084 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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MRPL28Q13084 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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MRPL28Q13084 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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MRPL28Q13084 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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MRPL28Q13084 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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MRPL28Q13084 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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MRPL28Q13084 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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MRPL28Q13084 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms