Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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