Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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