Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms